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不得抵扣进项税额,限制的是当期销项税额不得抵扣进项,没有限制当期取得的进项能否在以后得到抵扣,也就是没有否定当期取得进项的抵扣权益.
例：一般纳税人丙公司2019年5月份办理转登记，6月1日开始为小规模纳税人，假设6月份销售额600万元，7月份纳税申报期结束日为7月15日。北流恒企会计培训学校为大家详述如下，希望对你们有所帮助。
一、总局令第43号第八条，纳税人在年应税销售额超过规定标准的月份（或季度）的所属申报期结束后15日内办理相关手续。
2019年6月超标，超标所属期是6月，超标所属的申报期是7月，7月16日-7月30日15日内办理登记手续。
自行办理登记较迟时间：7月30日。
二、总局令第43号第八条，未按规定时限办理的，主管税务机关应当在规定时限结束后5日内制作《税务事项通知书》，告知纳税人应当在5日内向主管税务机关办理相关手续。
规定时限结束后5日内告知：7月31日-8月5日（8月3日、4日为周六、周日；总局公告2018年6号规定，在期限内有连续3日以上（含3日）法定休假日的，按休假日天数顺延，与征管法及其实施细则一致。3号、4号是周末，只有两天不顺延）。
纳税人应办理登记期间：8月6日-12日（8月10日、11日为周六、周日；按总局公告2018年第6号规定，较后一日11号是法定休假日的，以休假日期满的次日12号为期限的较后一日。所以顺延至12号）
连贯起来表述：7月30日前丙公司未办理登记，主管税务机关应在7月31日后5日内，制作并送达税收事项通知书。假设8月5日告知纳税人，应自8月6日起5日内办理登记手续。
告知应办理登记时间：8月6日-12日。
三、8月12日后，丙公司逾期仍不办理一般纳税人登记，9月起按销售额依照增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项，直至纳税人办理相关手续为止。
如果丙公司在8月12日办理了一般纳税人登记，并选择一般纳税人，生效之日选择为9/1。那么，所属期8月份，仍可按小规模纳税人简易征收。
经过对照条款分析：丙公司在5月份办理转登记的，至少可以有6月、7月和8月三个月的小规模纳税人身份。
四、续上例，再做深入分析：
假设1：丙公司在8/13日办理登记，如何处理？生效之日选择9/1起。
总局公告2018年第6号规定，逾期未办理的，自通知时限期满的次月起按销售额依照增值税税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，直至纳税人办理相关手续为止。
8月份仍然按照小规模纳税。
假设2：丙公司在9/16日办理登记，又如何处理？生效之日选择9/1起。
9/1-9/16期间，应按适用税率计征且不得抵扣。
然而（1）：9/1日起，丙公司已是一般纳税人，9/1-9/16期间的销售按适用税率征税，能不能开具增值税专票呢？
总局令43号规定，纳税人自一般纳税人生效之日起，按增值税一般计税方法计算应纳税额，并可按规定领用增值税专用发票，财政部、国家税务总局另有规定的除外。
则（1）：没有不得领用开具专票的规定，9/1-9/16期间可以开具增值税专票。
然而（2）：9/1-9/16期间取得的进项专票，今后能否正常勾选确认并抵扣？
文件只是规定计算应纳税额时不得抵扣进项，并没有规定在此期间取得的增值税专票今后不得抵扣。
不得抵扣进项税额与进项税额不得从销项税额中抵扣，是两种截然不同的表述。
不得抵扣进项税额，限制的是当期销项税额不得抵扣进项，没有限制当期取得的进项能否在以后得到抵扣，也就是没有否定当期取得进项的抵扣权益。
进项税额不得从销项税额中抵扣，直接否定了进项税额的抵扣权益。当然这里还要区分两种情况，一种是永久失去抵扣权，如用于简易计税和免税项目的购进货物、非正常损失的；另一种是暂时失去抵扣权，如专用于集体福利的固定资产、不动产。
并且，进项税额不得抵扣的相关规定，有增值税暂行条例和财税【2016】36号的相关规定，均未列举这种进项税额不得抵扣的情形。
则（2）：9/1-9/16期间取得的进项专票，可以在计算9月份应纳税额时抵扣9/17-9/30日的销项税额。
9月份应纳税额=9/1至9/16销售额*适用税率+9/17至9/30销售额*适用税率-进项税额
从以上分析可以看出：
如果后期登记为一般纳税人，按适用税率计算应纳税额，不得抵扣进项税额，只是相当于预缴税款，只是暂时改变了应纳税额的计算方式，只是影响了进销项计算抵扣的时间而已。实质上算不上是惩罚性条款，该条款并没有多大意义。
如果后期并未登记为一般纳税人，按适用税率缴纳的税款，就相当于改变了计税方式，就相当于规定了一种征税方式，就相当于加重了税负。而总局令作为部门规章，并没有权限作出补税等加重税负的法律权限，就有超越权限之嫌。
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